[BACK]Return to weight CVS log [TXT][DIR] Up to [local] / OpenXM_contrib2 / asir2000 / lib

Diff for /OpenXM_contrib2/asir2000/lib/weight between version 1.25 and 1.29

version 1.25, 2004/01/08 15:58:58 version 1.29, 2004/01/13 03:26:49
Line 120  def interval2value(A,Vars){
Line 120  def interval2value(A,Vars){
                 print("bug")$                  print("bug")$
                 return []$                  return []$
         }          }
           else if(length(B)==0){
         if(length(B)==0){                  if(fop(A)==0)
                 if(A)  
                         return [Vars,1]$                          return [Vars,1]$
                 else                  else
                         return []$                          return []$
Line 234  def bsort(A){
Line 233  def bsort(A){
         return A$          return A$
 }  }
   
 def perm(I,P,TMP){  def wsort(A,B,C,ID){
   
         if(I>0){          D=newvect(length(B))$
                 TMP=perm(I-1,P,TMP)$          for(I=0;I<length(B);I++)
                 for(J=I-1;J>=0;J--){                  D[I]=[A[I],B[I],C[I]]$
                         T=P[I]$  
                         P[I]=P[J]$  
                         P[J]=T$  
                         TMP=perm(I-1,P,TMP)$  
                         T=P[I]$  
                         P[I]=P[J]$  
                         P[J]=T$  
                 }  
   
                 return TMP$          D=bsort(D)$
         }  
         else{  
                 for(TMP0=[],K=0;K<size(P)[0];K++)  
                         TMP0=cons(P[K],TMP0)$  
   
                 TMP=cons(TMP0,TMP)$  
                 return TMP$  
         }  
 }  
   
 def marge(A,B){          for(E=[],I=0;I<length(B);I++)
                   E=cons(D[I][1],E)$
           E=reverse(E)$
   
         RET=[]$          for(F=[],I=0;I<length(B);I++)
         for(I=0;I<length(A);I++)                  F=cons(D[I][2],F)$
                 for(J=0;J<length(B);J++)          F=reverse(F)$
                         RET=cons(append(A[I],B[J]),RET)$  
   
         return RET$  
 }  
   
 def wsort(A,B,C,FLAG,ID){  
   
         if(FLAG==0){  
                 D=newvect(length(B))$  
                 for(I=0;I<length(B);I++)  
                         D[I]=[A[I],B[I],C[I]]$  
   
                 D=bsort(D)$  
                 E=[]$  
                 for(I=0;I<length(B);I++)  
                         E=cons(D[I][1],E)$  
                 E=reverse(E)$  
                 F=[]$  
                 for(I=0;I<length(B);I++)  
                         F=cons(D[I][2],F)$  
                 F=reverse(F)$  
   
                 return [[ID,E,F]]$          return [[ID,E,F]]$
         }  
         else{  
                 D=newvect(length(B))$  
                 for(I=0;I<length(B);I++)  
                         D[I]=[A[I],B[I],C[I]]$  
   
                 D=qsort(D,worder)$  
                 D0=[]$  
   
                 for(I=0,J=0,TMP=[],X=0;I<size(D)[0];I++){  
                         if(X==D[I][0])  
                                 TMP=cons(cdr(D[I]),TMP)$  
                         else{  
                                 D0=cons(TMP,D0)$  
                                 TMP=[]$  
                                 TMP=cons(cdr(D[I]),TMP)$  
                                 X=car(D[I])$  
                         }  
                 }  
                 D0=cdr(reverse(cons(TMP,D0)))$  
                 D0=map(ltov,D0)$  
                 for(I=0,TMP=[[]];I<length(D0);I++){  
                         TMP0=perm(length(D0[I])-1,D0[I],[])$  
                         TMP=marge(TMP,TMP0)$  
                 }  
   
                 RET=[]$  
                 for(I=0;I<length(TMP);I++){  
                         TMP0=[]$  
                         TMP1=[]$  
                         for(J=0;J<length(TMP[I]);J++){  
                                 TMP0=cons(TMP[I][J][0],TMP0)$  
                                 TMP1=cons(TMP[I][J][1],TMP1)$  
                         }  
                         TMP0=reverse(TMP0)$  
                         TMP1=reverse(TMP1)$  
   
                         RET=cons([ID,TMP0,TMP1],RET)$  
                 }  
   
                 return RET$  
         }  
 }  }
   
 def nonposdegchk(Res){  def nonposdegchk(Res){
Line 392  def makeret(Res,Vars,FLAG){
Line 313  def makeret(Res,Vars,FLAG){
   
         ResVec=newvect(ResNum)$          ResVec=newvect(ResNum)$
   
         for(M=0,I=0;I<ResNum;I++){          if(FLAG)
                   M=0$
           else
                   M=-1$
   
           for(I=0;I<ResNum;I++){
                 if(member(Res[I][0],Vars)){                  if(member(Res[I][0],Vars)){
                         ResVec[I]=Res[I][1]$                          ResVec[I]=Res[I][1]$
   
                         if(FLAG && type(ResVec[I])==1){                          if(FLAG){
                                 if(M==0)                                  if(type(ResVec[I])==1){
                                         M=ResVec[I]$                                          if(M==0)
                                 else                                                  M=ResVec[I]$
                                         if(ResVec[I]<M)                                          else
                                                 M=ResVec[I]$                                                  if(ResVec[I]<M)
                         }                                                          M=ResVec[I]$
                 }                                  }
                                   else
                                           M=-1$
                           }
                   }
         }          }
   
         if(M!=0)  
           if(M!=-1)
                 ResVec=ResVec/M;                  ResVec=ResVec/M;
   
         RET=newvect(VarsNum,Vars)$          RET=newvect(VarsNum,Vars)$
Line 588  def qcheck(PolyList,Vars,FLAG){
Line 519  def qcheck(PolyList,Vars,FLAG){
   
         if(nonposdegchk(Res)){          if(nonposdegchk(Res)){
   
                 ResVars=makeret(Res,Vars,0)$                  TMP1=makeret(Res,Vars,0)$
   
                 if(checktd(PolyList,Vars,ResVars[1])==1){                  if(checktd(PolyList,Vars,TMP1[1])==1){
                         if(ResVars[0]==0){  
                                 RET=append(RET,wsort(ResVars[1],Vars,  
                                         ResVars[1],FLAG,0))$  
   
                                 return RET$                          if(FLAG==0){
                         }  
                         else{  
   
                                 TMP=vtol(ResVars[1])$                                  if(TMP1[0]==0)
                                           RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,TMP1[1],0))$
                                   else{
   
 /*                                          TMP=vtol(TMP1[1])$
                                 RET=append(RET,[[0,Vars,TMP]])$                                          RET0=[]$
 */                                          if((TMP0=fixedpoint(TMP,0))!=[]){
   
                                 if((TMP0=fixedpoint(TMP,0))!=[]){  
   
                                         for(I=0;I<length(TMP0);I++)                                                  for(I=0;I<length(TMP0);I++)
                                                 TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],                                                          TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$
                                                         TMP0[I][1])$                                                  RET0=value2(Vars,TMP)$
                                                   if(RET0!=[])
                                         TMP=value2(Vars,TMP)$                                                          RET0=wsort(RET0,Vars,RET0,1/10)$
                                           }
                                         if(TMP!=[])  
                                                 RET=append(RET,wsort(TMP,Vars,                                          TMP=vtol(TMP1[1])$
                                                         TMP,FLAG,1/10))$                                          if(RET0==[] && (TMP0=fixedpoint(TMP,1))!=[]){
                                 }  
                                 else if((TMP0=fixedpoint(TMP,1))!=[]){  
   
                                         for(I=0;I<length(TMP0);I++)                                                  for(I=0;I<length(TMP0);I++)
                                                 TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],                                                          TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$
                                                         TMP0[I][1])$                                                  RET0=value2(Vars,TMP)$
   
                                         TMP=value2(Vars,TMP)$                                                  if(RET0!=[])
                                                           RET0=wsort(RET0,Vars,RET0,1/10)$
                                         if(TMP!=[])                                          }
                                                 RET=append(RET,wsort(TMP,Vars,                                          RET=append(RET,RET0)$
                                                         TMP,FLAG,1/10))$                                  }
                                 }  
   
                                 return RET$  
                         }                          }
                           else if(FLAG==1)
                                   RET=append(RET,[[0,Vars,vtol(TMP1[1])]])$
                 }                  }
                 else  
                         return []$  
         }          }
         else  
                 return []$  
   
           return RET$
 }  }
   
 def leastsq(NormMat,ExpMat,Vars,FLAG,ID){  def leastsq(NormMat,ExpMat,Vars,FLAG,ID){
Line 691  def leastsq(NormMat,ExpMat,Vars,FLAG,ID){
Line 611  def leastsq(NormMat,ExpMat,Vars,FLAG,ID){
   
                 TMP1=makeret(Res,Vars,1)$                  TMP1=makeret(Res,Vars,1)$
   
                 if(TMP1[0]==0){                  if(FLAG==0){
   
                         TMP=roundret(TMP1[1])$                          if(TMP1[0]==0){
   
                         RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,                                  TMP=roundret(TMP1[1])$
                                 map(drint,TMP1[1]*1.0),FLAG,ID))$  
   
                         if(TMP!=[])                                  RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,map(drint,TMP1[1]*1.0),ID))$
                                 RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,  
                                         TMP,FLAG,ID+1))$  
   
                         return RET$  
                 }  
                 else{  
   
                         TMP=vtol(TMP1[1])$  
   
 /*  
                         RET=append(RET,[[ID,Vars,vtol(TMP1[1])]])$  
 */  
   
                         if((TMP0=fixedpoint(TMP1[1],0))!=[]){  
   
                                 for(I=0;I<length(TMP0);I++)  
                                         TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$  
   
                                 TMP=value2(Vars,TMP)$  
   
                                 if(TMP!=[])                                  if(TMP!=[])
                                         RET=append(RET,                                          RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,TMP,ID+1))$
                                                 wsort(TMP,Vars,TMP,FLAG,ID+1/10))$                          }
                           else{
   
                         }                                  TMP=vtol(TMP1[1])$
                         else if((TMP0=fixedpoint(TMP1[1],1))!=[]){                                  RET0=[]$
                                   if((TMP0=fixedpoint(TMP,0))!=[]){
   
                                 for(I=0;I<length(TMP0);I++)                                          for(I=0;I<length(TMP0);I++)
                                         TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$                                                  TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$
                                           RET0=value2(Vars,TMP)$
                                           if(RET0!=[])
                                                   RET0=wsort(RET0,Vars,RET0,ID+1/10)$
                                   }
   
                                   TMP=vtol(TMP1[1])$
                                   if(RET0==[] && (TMP0=fixedpoint(TMP,1))!=[]){
   
                                           for(I=0;I<length(TMP0);I++)
                                                   TMP=map(subst,TMP,TMP0[I][0],TMP0[I][1])$
                                           RET0=value2(Vars,TMP)$
   
                                           if(RET0!=[])
                                                   RET0=wsort(RET0,Vars,RET0,ID+1/10)$
                                   }
   
                                 TMP=value2(Vars,TMP)$                                  RET=append(RET,RET0)$
                           }
   
                                 if(TMP!=[])  
                                         RET=append(RET,  
                                                 wsort(TMP,Vars,TMP,FLAG,ID+1/10))$  
                         }  
   
                         return RET$  
                 }                  }
                   else if(FLAG==1)
                           RET=append(RET,[[ID,Vars,vtol(TMP1[1])]])$
         }          }
         else  
                 return RET$  
   
           return RET$
 }  }
   
 def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){  def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){
Line 786  def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){
Line 699  def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){
         for(I=0;I<ExpMatColNum;I++)          for(I=0;I<ExpMatColNum;I++)
                 for(J=0;J<PolyListNum;J++)                  for(J=0;J<PolyListNum;J++)
                         for(K=OneMat[J];K<OneMat[J+1];K++)                          for(K=OneMat[J];K<OneMat[J+1];K++)
                                 NormMat1[I][J+ExpMatColNum]-=                                  NormMat1[I][J+ExpMatColNum]-=ExpMat[K][I]$
                                         ExpMat[K][I]$  
   
         for(I=0;I<PolyListNum;I++)          for(I=0;I<PolyListNum;I++)
                 NormMat1[I+ExpMatColNum][I+ExpMatColNum]=OneMat[I+1]-OneMat[I]$                  NormMat1[I+ExpMatColNum][I+ExpMatColNum]=OneMat[I+1]-OneMat[I]$
Line 805  def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){
Line 717  def unitweight(ExpMat,Vars,PolyListNum,OneMat,FLAG){
   
                         TMP1=makeret(Res,Vars,1)$                          TMP1=makeret(Res,Vars,1)$
   
                         TMP=roundret(TMP1[1])$                          if(FLAG==0){
                                   TMP=roundret(TMP1[1])$
   
                         RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,                                  RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,map(drint,TMP1[1]*1.0),1))$
                                 map(drint,TMP1[1]*1.0),FLAG,1))$  
   
                         if(TMP!=[])                                  if(TMP!=[])
                                 RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,                                          RET=append(RET,wsort(TMP1[1],Vars,TMP,2))$
                                         TMP,FLAG,2))$                          }
                           else if(FLAG==1)
                                   RET=append(RET,[[1,Vars,vtol(TMP1[1])]])$
                 }                  }
   
         }          }
   
         return [NormMat0,RET]$          return [NormMat0,RET]$
Legend:
Removed from v.1.25  
changed lines
  Added in v.1.29
FreeBSD-CVSweb <freebsd-cvsweb@FreeBSD.org>